Section: Dissemination

Teaching - Supervision - Juries

Teaching

• Licence:

  • Thomas Lepoutre, Groupe de lecture, L3, ENS, Lyon.

  • Samuel Bernard, Linear and matrix algebra,30h ETD, INSA, Lyon.

  • Samuel Bernard, ODEs for neuroscience,10h ETD, INSA Lyon.

  • Laurent Pujo-Menjouet, Fondamentaux des mathématiques, 138h ETD, L1, UCBL, Lyon.

  • Laurent Pujo-Menjouet, Bio-mathématiques et modélisation, 10.5h ETD, L3, UCBL, Lyon.

  • Laurent Pujo-Menjouet, Introduction à l’analyse numérique, 60h ETD, L2, UCBL, Lyon.

  • Léon Tine, Fondamentaux des mathématiques, 80h ETD, L1, UCBL, Lyon.

  • Léon Tine, Techniques mathématiques de base, 70h ETD, L1, UCBL, Lyon.

  • Léon Tine, Maths pour enseignement, 10h ETD, 10h ETD, L3, UCBL, Lyon.

• Master:

  • Thomas Lepoutre, Agrégation, 30h ETD, M2, UCBL, Lyon.

  • Samuel Bernard, Cell population dynamics, 15h ETD, UCBL, Lyon.

  • Fabien Crauste, Population Dynamics, 9h ETD, M2, UCBL, Lyon.

  • Laurent Pujo-Menjouet, Systèmes Dynamiques, 72h ETD, M1, UCBL, Lyon.

  • Laurent Pujo-Menjouet, Network Algorithms for Molecular Biology, 7.5h ETD, Master 2 IXXI, ENS, Lyon.

  • Léon Tine, Épidémiologie, 30h ETD, M2, UCBL, Lyon.

Supervision

• PhD in progress: Simon Girel, “Multiscale modeling of the immune response”, Université Lyon, since September 2015, supervisor: Fabien Crauste.

• PhD in progress: Aurélien Canet, “Contribution à l’étude de la quantification de la réponse d’une tumeur solide après un traitement par radiothérapie”, Université Lyon, since January 2016, supervisors: Larry Bodgi, Nicolas Foray and Laurent Pujo-Menjouet.

• PhD in progress: Loïs Boullu, “Modélisation de la mégacaryopoïèse et applications aux maladies liées â la production des plaquettes”, Université Lyon 1, October 2014, supervisors: Laurent Pujo-Menjouet and Jacques Bélair (co-tutelle avec l'Université de Montréal).

• PhD: Loïc Barbarroux, “Contributions to the multiscale modeling of the CD8 immune response : design, analysis, simulation and calibration of mathematical models”, Université de Lyon 1, July 2017, supervisors: Mostafa Adimy and Phillipe Michel.

• PhD: Apollos Besse, “Mathematical Modeling of Chronic Myelogenous Leukemia”, Université de Lyon, July 2017, supervisors: Samuel Bernard and Thomas Lepoutre.

• PhD in progress: Ulysse Herbach, “Modèles graphiques probabilistes pour l’inférence de réseaux de gènes”, Université Lyon 1, since October 2015, supervisors: Olivier Gandrillon, Thibault Espinasse (ICJ) and Anne-Laure Fougères (ICJ).

• PhD in progress: Arnaud Bonnafoux, “Vers une inférence automatique de réseaux de gènes dynamiques à partir de “mégadonnées” temporelles discrètes acquises sur cellules uniques”, Université Lyon 1, since November 2015, supervisors: Olivier Gandrillon (CIFRE with the COSMO company).

• PhD in progress: Ronan Duchesne, “Vers un modèle multi-échelle de la différentiation cellulaire : Application à la différentiation érythrocytaire”, École normale supérieure de Lyon and Université Lyon 1, since September 2016, supervisors: Olivier Gandrillon and Fabien Crauste.

• PhD: Anass Bouchnita, “Mathematical modeling of blood coagulation and thrombus formation under flow in normal and pathological conditions”, Université Claude Bernard Lyon, Ecole Mohammadia d’Ingénieurs and Université Mohammed V de Rabat (Maroc), December 2017, supervisor: Vitaly Volpert.

• PhD: Tatiana Galochkina, “Mathematical modeling of blood inflammation processes and the problem of blood purification”, Université Claude Bernard Lyon and Moscow State University, Novmber 2017, supervisor: Vitaly Volpert.

• HDR: Samuel Bernard, “Structured differential equations and multiscale approaches for human cell population dynamics”, Université Claude Bernard Lyon, June 2017.

• HDR: Thomas Leoutre, “Contributions en dynamique de populations”, Université Claude Bernard Lyon, April 2017.

Juries

• Thomas Lepoutre was reviewer and member of the PhD of Athmane Bakhta (Université Paris Est ), “Modèles mathématiques et simulation numérique de dispositifs photovoltaïques”.

• Samuel Bernard was member of Charles Rocabert PhD defense committee (INSA Lyon), “Etude de l'évolution des micro-organismes bactériens par des approches de modélisation et de simulation numériques”.

• Samuel Bernard was member of Apollos Besse PhD defense committee (INSA Lyon), “Modélisation Mathématique de la Leucémie Myéloïde Chronique".

• Olivier Gandrillon was president of the jury for the PhD of Alice Moussy (École Pratique des Hautes Études, Paris), “Caractérisation des premières étapes de différenciation des cellules hématopoïétiques à l’échelle de la cellule unique” and for the PhD of Coraline Petit (ENS Lyon), “Évolution et Développement d’un organe sériel : la molaire. Transcriptomique comparée des bourgeons de molaires chez les rongeurs”.

• Laurent Pujo-Menjouet was a jury member of the Habilitation thesis of Samuel Bernard (Université Claude Bernard Lyon 1), “Structured differential equations and multiscale approaches for human cell population dynamics”. He was also a jury member of the PhD of Tatiana Galochkina (université de Lyon et Université d’état de Moscou), “Structure spatiale des lipopolysaccharides et son rôle dans la coagulation sanguine”.

• Mostafa Adimy was member of Loïc Barbarroux PhD defense commitee (École Centrale de Lyon), “Contributions to the multiscale modeling of the CD8 immune response : design, analysis, simulation and calibration of mathematical models” and Walid Djema PhD defense commitee (Université Paris-Sud), “Understanding Cell Dynamics in Cancer from Control and Mathematical Biology Standpoints Particular Insights into the Modeling and Analysis Aspects in Hematopoietic Systems and Leukemia”.